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与阳极电泳相比，阴极电泳具有漆膜性能好、涂层均匀、漆膜色泽不变深、有色金属也能涂覆等特点，但也存在着某些缺点。分析如下：
（1）阴极电泳漆比阳极电泳漆具有显著的耐腐蚀性，在脱脂钢板上其耐腐蚀时间一般为阳极电泳漆的3~4倍，超过了经磷化处理的阳极电泳漆。在锌盐磷化钢板上，其耐腐蚀性为阳极电泳漆的2~3倍，在某些情况下甚至可达10倍。国外曾对阴、阳极电泳涂装的汽车车身在盐雾室中作过对比试验，结果阳极电泳涂屋经250H已被破坏，而阴极电泳涂层经1700H试验后尚未被破坏 。
阴极电泳漆的泳透力也比阳极电泳漆高，通常是阳极电泳的1.3~1.5倍 ，这就使得阴极电泳在进行复杂工件内部（如汽车车身）涂装时，可以省略辅助电极，从而简化了电泳涂装工艺和材料消耗。
阴极电泳漆在电泳涂装时库仑效率较高，通常是阳极电泳的2~3倍，可减少30%的耗电量。电泳设备所需冷冻机的容量也较小。
阴极电泳漆的耐碱性也比阳极电泳漆高，从实验数据表明，阴极电泳漆膜比阳极电泳漆膜的耐碱性（5%NaOH溶液）通常高20~40倍 。
阴极电泳槽液比较稳定，易控制，不易受杂质离子和微生物的影响而变质。
虽然阴极电泳漆的价格较阳极电泳漆贵（国外一般是贵1.3~1.5倍），但由于工艺简化（不有设置辅助电极），库仑效率高，涂装漆膜薄（一般是10~13um的阴极电泳涂膜的耐腐蚀性就明显地优于20~25um的阳极电泳涂膜）等原因，因此阴极电泳涂装的综合成本反而低于阳极电泳涂装的综合成本。
（2）阴极电泳漆的PH值在弱酸性范围内，虽然接近中性，但还是有一定期的腐蚀性，因而阴极电泳设备的一些关键部件如：输送泵配管和热交换器等仍然要用不锈钢制造，设备费用提高。
由于阴极电泳漆所用的树脂是附着在漆膜上的，所以槽液与阳极电泳漆相比，不易溶解，电泳后的水洗比较困难，若电泳后不及时进行水洗，附着在工件表面的漆液易干固，就更难清洗了。
阴极电泳涂层在烘干过程中产生的排泄物较多，易产生臭味并粘附在烘道设备上。
阴极电泳漆膜的耐候性较差。这是由于现有的阴极电泳涂料还是以环氧树脂为基础。如果以宽作为三层涂漆的底层时问题不大，若为双层涂层的底漆时就要考虑面层光线透过率，若透过率太大，电泳底漆就容易粉化从而导致面漆剥落。
虽然阴极电泳漆比较稳定，不易变黄，但在管理上要比阳极电泳涂装复杂，如搅拌、漆温、PH值、水洗、表面处理等均要严格控制，否则就得不到理想的涂层。同时由于烘干时生成的排泄物较多，所以为了保证产品质量，烘干室的换气量较大，清理次数也要多些。
